Trên xe GLK có rất nhiều hệ thống an toàn phối hợp chặt chẽ với nhau để thực hiện nhiệm vụ bảo vệ. Tuy nhiên nếu khả năng xấu nhất xảy ra, cũng những hệ thống bảo vệ người đi đường và người đi xe giúp làm giảm đáng kể những rủi ro chấn thương khi tai nạn xảy ra. Sẽ có các túi khí hoạt động bao gồm túi khí 2 giai đoạn cho người lái, túi khí cho hành khách phía trước, các túi khí bên cạnh và trên cửa sổ kéo dài qua 2 hàng ghế, đảm bảo phạm vi bảo vệ gần như toàn bộ hai bên thân xe. Các túi khí bên hông và cửa sổ được điều khiển bởi các cảm biến áp lực: nếu cửa xe bị biến dạng do va chạm từ bên hông xe, cảm biến sẽ ghi nhận sự gia tăng đột ngột áp lực không khí giữa khung thân xe và nội thất và thông báo tới bộ điều khiển để kích nổ túi khí.

Hệ thống bảo vệ đầu và cổ NECK-PRO cũng là một ví dụ, đây là trang bị tiêu chuẩn cho mọi ghế trước: khi cảm biến phát hiện va chạm từ phía sau, nó sẽ đẩy đệm tựa đầu về phía trước trong khoảng vài phần nghìn giây để bảo đảm điểm tựa cho đầu người ngồi ghế trước, các lò xo sẽ đẩy tựa đầu ra trước 56mm và lên cao 23mm để đỡ vùng đầu, nhờ đó giảm đáng kể tỷ lệ chấn thương cổ.