Hệ thống điều hòa khí hậu tự động THERMATIC đảm bảo duy trì bầu không khí dễ chịu trên xe CLS, trong bất kỳ điều kiện thời tiết nào. Hệ thống điều hòa khí hậu 4 vùng THERMOTRONIC (tùy chọn) mang đến những tiện nghi cao cấp hơn nữa.
Hệ thống THERMOTRONIC có thêm các cửa sổ gió có thể điều chỉnh cho hành khách phía sau, cho phép hành khách và người lái lựa chọn nhiệt độ thích hợp cho riêng mình. Các cảm biết sẽ kiểm tra cường độ của ánh nắng mặt trời và nhiệt độ bên trong của cả bốn vùng khí hậu trên xe để tự điều chỉnh nhiệt độ thích hợp. Một thiết bị lọc kết hợp giúp cải thiện chất lượng không khí trong xe. Khi xe đi qua vùng không khí ô nhiễm, nắp quạt gió của hệ thống điều hòa không khí sẽ tự động đóng lại.
THERMOTRONIC được trang bị tiêu chuẩn cho xe CLS 350 do Mecedes-Benz Việt Nam chính thức nhập về.